《米小圈學校》三年級第二季講述了調皮、聰明、聰明、勇敢的孩子們為主角，與「鐵三角」在校園裡共同生活、成長的故事。故事分為校園生活和家庭兩個場景。在一個溫馨充滿愛的家庭裡，米小圈和父親總是能製造出讓米媽媽煩惱的事；在豐富多彩的校園生活中，米小圈和同學們學習了豐富的科學知識，並參與了校內外的各種活動。各種有趣的活動，共同解決難題和疑慮，最終成長為更好的人。